قبل وفاة القدّيس شربل بمئة سنة، أي سنة 1798، شرع يوسف بو رميا وداود عيسى خليفة من اهمج، في بناء دير، وذلك على تلّة رويسة عنّايا.
أنـهى يوسف وداود بناء الدير سنة 1811، سّميا المعبد الذي شُيِّد فوق أنقاض قديمة على اسم "تجلي الرب"، وكانت غايتهما أن ينقطعا فيها إلى عيشة النساك زهداً بالعالم.
حوّل البطريرك الماروني يوحنا الحلو، في 9 آب 1812، اسم شفاعة المعبد من "التجلّي" الى الرسولين بطرس وبولس الواقع عيدهما في 29 حزيران. وعُرف المقام منذئذٍ "بدير مار بطرس وبولس" بدل "دير التجلّي".
لمّا كانت هناك حاجة إلى كاهن للاهتمام بالخدمة الروحية، طلب يوسف وداود من رئيس عام الرهبانية اللبنانية المارونية الأب اغناطيوس بليبل، في 20 تشرين الثاني 1814، كاهناً ليقوم بهذه المهّمة. ففوّضا إليه مطلق التصرّف في المعبد وفي الأرض التي تخصّه، وذلك بموجب مرسوم وجّهه البطريرك يوحنا الحلو إلى الأب العام.
ابتداءً من سنة 1814، تخلّى هؤلاء العبّاد عن مقام مار بطرس وبولس مع ما حوله من أملاك وانضمّوا إلى الرهبانية اللبنانية، وظلّ الأخ يوسف في دير مار مارون عنّايا إلى أن توّفي بعد شيخوخة صالحة.
أما دير العبادة هذا، أي "دير مار بطرس وبولس"، فجُعِلَ محبسة لاحقاً على الأرجح سنة 1828، أي في السنة التي انتهى فيها البناء الأول في دير مار مارون عنّايا وهي السنة التي وُلِدَ فيها مار شربل. وأوّل حبيس دخل هذه المحبسة من أبناء الرهبانية، هو رجل الله الأب اليشاع الحرديني شقيق الطوباوي نعمة الله الحرديني.