Saint Charbel passa les 23 dernières années de sa vie à l'ermitage Saints Pierre et Paul où il rendit l'âme. L'ermitage s'éloigne du couvent de 15 minutes environ à pied et l'on peut parvenir en voiture au parvis inférieur. Les pièces les plus importantes à visiter à l'ermitage sont l'église, les chambres des ermites, la chambre de Saint Charbel, une pièce mise en place en tant que musée des outils et des ustensiles utilisés par Saint Charbel et les ermites ainsi que la pièce où Saint Charbel mourut. L'ermitage est un endroit de recueillement émouvant dans lequel on prend plaisir à prier surtout qu'il inspire un silence absolu tout en donnant sur de rares paysages naturels.